1/ DEFIER LE SOLEIL
Edward est déjà un grand alchimiste. Accompagné de son frère, dont l'âme a trouver refuge dans une énorme armure, il se rend à la cité de Lior où on pratique le culte du Dieu Soleil Letho, sous le regard attentif du prêtre Cornello. Ce dernier se prétend guérisseur et capable de réaliser des miracles. Mais Edward n'y croit pas une seconde et découvre son subterfuge...
2/ LE CORPS D'UN CONDAMNE
Grâce à la pierre philosophale. Cornello des pouvoirs très impressionants. Connaissant le secret du grand prêtre, Edward et Alphonse vont s'opposer à lui. Mais les habitants de Lior ont parti pour Cornello et forcent les deux frères à quitter la ville. La puissance de Cornello finit par frappé Al qui est détruit alors qu'Ed est conduit devant Cornello...
3/ MAMAN...
Les deux frères apprenaient l'alchimie sous le regard de leur mère. Mais un jour celle-ci fut terrassée par la maladie et décéda. Ils se sont alors juré de la ramener à la vie grace à l'alchimie. Ils ont étudier toutes les possibilités pour tenter l'expérience interdite. Mais leur tentative est un échec total. Alphonse perd son corps, et son ame a juste le temps de se réfugier dans une énorme armure grace à l'intervention d'Edward, lequel perd son bras et une jambe...
4/ LE TRAFIQUANT D'AMES
Au cours de l'expérience interdite, Ed a perdu un bras et une jambe. Aujourd'hui équipé de deux auto-mails, il fait la connaissance du lieutenant-colonel Roy Mustang, un alchimiste d'état. En discutant avec lui, Ed apprend l'existence d'un alchimiste nommé Mahjal, lequel pratiquerait, selon des rumeurs, l'alchimie humaine...
5/ L'HOMME AU BRAS BIONIQUE
Après leur rencontre avec Mahjal, Ed et Al décident de retourner dans la capital. Ils montent dans un train où ils aperçoivent le général Hakuro entouré de sa famille. C'était alors qu'un groupe de terroristes attaquent le train pour tenter de prendre le général en otage. Mais Ed, Al et le lieutenant-colonel Huges vont tout faire pour les en empecher...
6/ L'EXAMIN D'ENTREE
Ed et Al arrivent enfin à la cité central. Grace à l'aide précieuse de Mustang, ils seront logés chez Sho Tucker, un alchimistede renom. Ils vont rapidement se lier d'amitié avec la fille de celui-ci, Nina, et son chien Alexander. Pendant ce temps, le jour de l'examin d'entrée à l'Académie Nationale d'Alchimie approche de plus en plus...